Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap3Q99LM2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap3Q99LM2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap3Q99LM2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap3Q99LM2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap3Q99LM2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap3Q99LM2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap3Q99LM2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms