Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm3Q99LJ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm3Q99LJ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms