Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf144aQ925F3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnf144aQ925F3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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