Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Synpo2Q91YE8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Synpo2Q91YE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Synpo2Q91YE8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Synpo2Q91YE8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms