Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep57l1Q8VDS7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms