Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rassf9Q8K342 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rassf9Q8K342 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rassf9Q8K342 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rassf9Q8K342 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rassf9Q8K342 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms