Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd3Q8K2F0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd3Q8K2F0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.7 ms