Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpa1Q8BLA8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trpa1Q8BLA8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms