Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms