Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI1

Trnp1, TMF-regulated nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trnp1Q80ZI1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trnp1Q80ZI1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trnp1Q80ZI1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms