Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pip4k2bQ80XI4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pip4k2bQ80XI4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pip4k2bQ80XI4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pip4k2bQ80XI4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms