Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim17Q7TPM3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim17Q7TPM3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim17Q7TPM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms