Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd3eapQ76KJ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd3eapQ76KJ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd3eapQ76KJ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms