Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trak1Q6PD31 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Trak1Q6PD31 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trak1Q6PD31 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms