Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smchd1Q6P5D8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Smchd1Q6P5D8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smchd1Q6P5D8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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