Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufa4Q62425 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndufa4Q62425 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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