Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bbs12Q5SUD9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bbs12Q5SUD9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Bbs12Q5SUD9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms