Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mdc1Q5PSV9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mdc1Q5PSV9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Mdc1Q5PSV9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms