Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc1Q5NCF2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms