Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkaa1Q5EG47 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms