Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2cd3Q52KB6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2cd3Q52KB6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2cd3Q52KB6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2cd3Q52KB6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C2cd3Q52KB6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C2cd3Q52KB6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C2cd3Q52KB6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms