Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otol1Q4ZJM7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otol1Q4ZJM7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms