Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc27Q3V036 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc27Q3V036 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms