Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nkain3Q3URJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkain3Q3URJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms