Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ulk3Q3U3Q1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ulk3Q3U3Q1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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