Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctu2Q3U308 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu2Q3U308 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu2Q3U308 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms