Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srebf2Q3U1N2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srebf2Q3U1N2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srebf2Q3U1N2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srebf2Q3U1N2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms