Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TchpQ3TVW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TchpQ3TVW5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms