Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib3Q0P523 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cib3Q0P523 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms