Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdr16c6Q05A13 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms