Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VldlrP98156 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VldlrP98156 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms