Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frat1P70339 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frat1P70339 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frat1P70339 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Frat1P70339 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frat1P70339 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms