Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rpl31P62900 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpl31P62900 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196 ms