Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcmtd1P59913 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcmtd1P59913 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms