Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capza1P47753 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capza1P47753 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms