Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TfamP40630 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TfamP40630 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TfamP40630 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TfamP40630 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TfamP40630 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TfamP40630 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TfamP40630 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TfamP40630 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TfamP40630 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TfamP40630 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TfamP40630 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TfamP40630 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TfamP40630 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TfamP40630 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TfamP40630 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TfamP40630 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TfamP40630 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TfamP40630 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TfamP40630 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TfamP40630 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TfamP40630 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TfamP40630 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TfamP40630 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TfamP40630 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TfamP40630 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms