Protein–RNA interactions for Protein: P32442

Meox1, Homeobox protein MOX-1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meox1P32442 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Meox1P32442 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Meox1P32442 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Meox1P32442 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Meox1P32442 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Meox1P32442 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Meox1P32442 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms