Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ctnnd1P30999 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctnnd1P30999 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctnnd1P30999 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms