Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp1P29452 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp1P29452 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casp1P29452 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casp1P29452 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp1P29452 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp1P29452 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp1P29452 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casp1P29452 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Casp1P29452 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp1P29452 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp1P29452 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms