Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd8P23463 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxd8P23463 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd8P23463 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd8P23463 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms