Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phka1P18826 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phka1P18826 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phka1P18826 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phka1P18826 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phka1P18826 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms