Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RhoP15409 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RhoP15409 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RhoP15409 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoP15409 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoP15409 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoP15409 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoP15409 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RhoP15409 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoP15409 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoP15409 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoP15409 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RhoP15409 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RhoP15409 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RhoP15409 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RhoP15409 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RhoP15409 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RhoP15409 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RhoP15409 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RhoP15409 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhoP15409 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RhoP15409 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RhoP15409 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RhoP15409 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms