Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AppP12023 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AppP12023 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AppP12023 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AppP12023 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AppP12023 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AppP12023 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AppP12023 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AppP12023 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AppP12023 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AppP12023 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AppP12023 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AppP12023 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AppP12023 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AppP12023 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AppP12023 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AppP12023 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AppP12023 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AppP12023 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AppP12023 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AppP12023 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AppP12023 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AppP12023 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AppP12023 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AppP12023 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AppP12023 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AppP12023 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AppP12023 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AppP12023 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AppP12023 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AppP12023 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AppP12023 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AppP12023 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AppP12023 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AppP12023 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AppP12023 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AppP12023 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AppP12023 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AppP12023 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AppP12023 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AppP12023 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AppP12023 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms