Protein–RNA interactions for Protein: P04944

Ig kappa chain V-VI region NQ5-78.2.6, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04944 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04944 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04944 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04944 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04944 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04944 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04944 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04944 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04944 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04944 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04944 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms