Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01736 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01736 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01736 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01736 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01736 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01736 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01736 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01736 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01736 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01736 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01736 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01736 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01736 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01736 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01736 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01736 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01736 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01736 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01736 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01736 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms