Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb10O35955 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb10O35955 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb10O35955 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms