Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nedd9O35177 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Nedd9O35177 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Nedd9O35177 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Nedd9O35177 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd9O35177 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Nedd9O35177 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nedd9O35177 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Nedd9O35177 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd9O35177 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nedd9O35177 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Nedd9O35177 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Nedd9O35177 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Nedd9O35177 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd9O35177 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd9O35177 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nedd9O35177 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd9O35177 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd9O35177 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd9O35177 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd9O35177 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nedd9O35177 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Nedd9O35177 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nedd9O35177 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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