Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna4O08542 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna4O08542 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efna4O08542 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna4O08542 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efna4O08542 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efna4O08542 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms