Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm8356J3QPD3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm8356J3QPD3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm8356J3QPD3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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