Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c3J3QJW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms